柴油机组装厂家应该注意以下环境保护问题：

1. 废气排放：柴油机组装过程中会产生大量废气，如排放到大气中，会对环境造成污染。因此，柴油机组装厂家应该采取有效的措施，如安装废气处理设备、加强通风等，减少废气排放对环境的影响。

2. 废水处理：柴油机组装过程中会产生废水，如排放到自然水体中，会对水质造成污染。因此，柴油机组装厂家应该采取有效的措施，如安装废水处理设备、加强废水收集等，减少废水对环境的影响。

3. 废物处理：柴油机组装过程中会产生大量废物，如不加以处理，会对环境造成污染。因此，柴油机组装厂家应该采取有效的措施，如分类收集、安全处理等，减少废物对环境的影响。

4. 节能减排：柴油机组装厂家应该采取节能减排措施，如采用节能设备、加强能源管理等，减少能源消耗和环境污染。

5. 环保宣传：柴油机组装厂家应该加强环保宣传，提高员工环保意识，推广环保技术和理念，共同营造良好的环保氛围。

需要注意的是，柴油机组装厂家应该严格遵守环保法规和标准，加强环保管理，定期进行环保评估和监测，及时发现和处理环境问题，保护环境和人民健康。